事业单位内部审计绩效评估是指一个评估并与审计人员沟通其工作干得怎么样，以及制定绩效改进的过程。如果绩效评估进行得恰当，那么它不仅可以使审计人员知道自己表现如何，而且还能影响他们未来的努力程度和工作方向。如果审计人员得到了适当的鼓励，他们就会更加努力。通过制定绩效改进计划，事业单位内部审计人员对本职工作内容的理解会更加清晰。
从宏观层次来分析，事业单位内部审计绩效评估的一个最常见的用途是为制定与提升、解雇、临时解雇和绩效加薪有关的管理决策提供依据。例如一名审计人员当前的工作绩效通常是决定其能否得到提升和加薪最重要的考虑因素。虽然在当前职位上的成功业绩并不一定意味着审计人员将胜任更高一级的职位，但是绩效评估的确为事业单位审计管理工作提供了许多预测信息。
其次，事业单位内部审计绩效评估信息还能为确定个人和本单位对培训和发展方面的需求提供必要的依据。例如事业单位内部审计绩效评估信息可以先用来鉴别审计人员的优缺点，然后，再用这些数据信息辅助确定事业单位的总体审计绩效、总体培训和发展需求。对于审计人员个人而言，一项完整的绩效评估应包括一个简要说明具体培训和发展需求的计划。
再次，事业单位内部审计绩效评估的另一个重要作用是鼓励绩效改进，就此而言，事业单位内部审计绩效评估是一种与审计人员沟通他们目前的绩效水平，并建议他们在行为、态度、技能或者知识等方面所需改进的手段。这种反馈向审计人员清晰地阐释了事业单位以及上级管理人员对内部审计工作的期望。通常在这种反馈之后，事业单位管理人员还必须通过辅导和培训来引导审计人员努力工作。
另一方面，事业单位内部审计绩效评估信息还有两大作用——其一，用于确定甄选程序的有效性；其二，优化事业单位内部人力资源规划。