自2012年始，现代学徒制试点工作稳步推进，其中不乏取得良好效果的试点院校，比如滨州职业技术学院、长春职业技术学院等等，但在此过程中出现的问题也是应该引起我们关注的，主要表现为以下几方面：
（一）企业参与现代学徒制建设动机不足
现代学徒制区别于传统学徒制，而是在政府部门的引导下，高职院校、学生和用人单位也就是企业三方以合同形式构建的一种新型的职业教育制度，以达到既可以完成学校理论知识的习得又可以解决企业对于高技能人才的需求，也帮助高职院校学生就业的问题，可谓是实现了“三赢”。但在实际操作过程中，虽然企业与学校、学生签有合作育人合同和学徒合同，明确规定了学生在培训期间可以获得一定比例的工资待遇，企业也对学生有教育和培训的义务，且帮助学校按时、保质地完成教学计划，但企业明显存在“缺位”现象，多数企业在培育学生过程中动机不足，认为教书育人只是学校的工作，再加上就业市场供过于求，企业的“搭便车”行为明显，直接影响现代学徒制建设中对人才质量的追求。
（二）尚未建立能够满足现代学徒制建设的师资队伍
教师是学校最重要的人力资源，在现代学徒制建设过程中，构建一支理论知识扎实、专业技能过硬的师资队伍是基本保障。目前我国高职院校招聘教师受学历要求的影响，一般进入学校从事教学活动的都是某高校毕业的研究生，比如河南省高职院校招聘第一条就要求必须是硕士研究生以上学历，为此，学校会邀请企业当中真正拥有熟练操作技能的技师参与到教学活动中来，但随之又发现这批技师虽然专业技能突出，但由于不熟悉教学理论方法以及素质修养未达标也会对学生素质的培养带来不良影响。而且按照人才培养方案在第三学期开始大量在企业实际工作环境进行学习的时候也发现，分配的“师傅”还会由于所带学徒多、怕影响自己工作效率等出现“怠工”现象，直接影响学生技能的掌握。
（三）现代学徒制的重要性未得到社会的广泛认可
受人们对职业教育错误认知的影响，社会上人们对于发展现代学徒制的意义认识也不到位。在我国，人们普遍认为职业教育是未能顺利进入高等院校学生无奈的选择，甚至，大多数高职院校学生自己也是这样认为的。因此，对于在高职院校中进行的现代学徒制改革社会上有关行业协会也没有予以充分的重视，尤其是与高等教育相比，现代学徒制建设缺乏有效支持的“土壤”。