1. 销售规模化程度低
现阶段，海南农产品电商主要面对的是国内市场，在国际市场所占份额很低，这是因为当地农产品的线上销售主体是大多是个体户和中小型农企，其中部分产品是借助“京东·中国特产海南馆”、淘宝“特色中国·海南馆”和1号店“屯昌馆”等进驻海南的大企业平台，采用B2C的模式进行销售，且通常是小批量进行交易，难以形成适度规模的网络零售销量。但农产品不同于其他商品，具有难储存、难运输、易变质、易损坏的特性，对保鲜技术和时效性要求很高，单价普遍较低，但包装、物流、装卸和仓储环节的损耗开支较大，因此成本偏高，小批量交易的盈利空间很小，甚至产生亏损。同时，销售规模化程度低难以形成集群效应，容易导致产品同质化程度高，质量良莠不齐，产品溢价能力弱，还可能产生恶性竞争，这都将严重阻碍海南农产品电子商务的发展，跨境农产品电商的发展则更为艰难。
2. 基础设施建设加快
2019年海南省政府工作报告中指出，2018年全省新增公路4337公里，路网密度提升至103公里/百平方公里，农村公路建管养运水平提升；自然村光纤宽带网络覆盖率达81%，4G网络信号覆盖率达98%；电网改造成效明显，全省年户平均停电时间降到23.5小时。全省（尤其是乡村）基础设施的建设和完善极大程度地改善了海南特色农产品的生产和加工环境，进一步推动当地农产品线上销售模式的发展进程，拓宽销售渠道，提升运输便利性，为跨境电商发展奠定基础。
3. 运输效率提高
近年来，海南省贸易出口效率提高，农产品跨境物流时间缩短，主要是因为：一，提升大数据中心功能，初步建立了物流进出岛有效管控的技术框架，；二，对外开放程度进一步扩大，2018年海南省的国际航线增加到74条，集装箱国际班轮航线增至9条，洋浦开通了到新加坡、越南的集装箱班轮，成为国际陆海贸易新通道的新支点；三，简化企业的“走出去”流程，全程网上申报审批，3个工作日可办结；四，国际贸易“单一窗口”国家标准版覆盖了海空港口岸，并拓展至海关特殊监管区，海南升级版启动建设，口岸建设和服务水平均有所提高，整体通关时间压缩了三分之一。
4 .特色热带农产品的国际影响力逐渐扩大
据统计，2018年中国（海南）国际热带农产品冬季交易会5天共签订农产品订单总额772.37亿元，比上届增加106.08亿元，农产品订单历届最高；线上交易额4.32亿元，比上届增加近2亿元，现场订单额44.91亿元，现场销售额1.8亿元，销售金额历届最高。“2018一带一路全媒体看冬交”主题活动还邀请了“一带一路”沿线国家16家主流媒体深入省内一些市县、企业、合作社进行采风，聚焦宣传海南热带特色高效农业的成效和亮点，扩大影响力。此外，海南省还加强了与“一带一路”沿线国家的农业科技合作，目前已在柬埔寨桔井省建设有香蕉、胡椒、木薯、橡胶、榴莲和香水椰子6个品种的核心示范基地，与乌兹别克斯坦就特色农产品贸易进出口方面开展合作，在以色列、斯里兰卡、菲律宾、泰国等国家也将陆续达成相关合作。海南省特色农产品的出口量也在逐渐加大。据中华人民共和国海口海关统计，2018年，与海南有贸易往来的国家及地区有161个，东盟、美国和欧盟是前三大贸易伙伴。2019年1月，海南省农产品的出口总额为5,500.99万美元，同比增长10.12%。其中，蔬菜类出口额104.88万美元，鲜、干水果及坚果为1.95万美元，果蔬汁和茶叶的出口额分别为41.51和9.43万美元。无核荔枝出口至澳大利亚，预计出口量将从2018年的5万斤提高到2019年的8万斤。此外，海南省对印度、埃及和土耳其等国家的出口量也有明显上涨。