1．麦种麦禾与大海水众沤
唯识宗认为种子是潜藏在现实世界背后的种子，是现实世界的原因。阿赖耶识是内种，麦种是外种，现实世界和种识的关係正如麦种和麦禾的关係，二者各有自体。是能生与所生、潜在与现实的关係。
熊十力认为不应该把种识和现行区分为两个世界，应该将两者理解为体用的关係。种识是体，现行是用。两者在同一界。“体既不是离用而别有物，用也不是以体为能生而自为所生。”本体与事物是大海水与波涛的关係：
“当知是事自有真源（真源，为本体之形容词）。比如临洋海岸，谛观众沤，故故不留、新新而起，应知一一沤，各各由大海水为其真源。尼父川上之叹，睹逝水而认真常，神悟天启，非上圣其能若是哉？”
2．多元的种子与一元的本心
唯识宗认为，本识作为能藏，“像一座奇异的仓库一样，里边储藏著各种各样的种子” 种子各式各样且相互独立，被藏于阿赖耶识中。
比如按其性质，种子可分为有漏和无漏两种，《成唯识论》卷二解释说：“诸种子者，谓异熟识所持一切有漏法种，此识性摄，故是所缘。无漏法种，虽依附此识，而非此性摄，故非所缘。”有漏种子为阿赖耶识所摄，称所缘，无漏种子依附於阿赖耶识，却不为其所舌，为非所缘。按种子变现的事物，又可划分为共相种子和不共相种子。即你我共同变现的事物如高山河流，眼耳只由个人的阿赖耶识变现，为不共相种子。
熊十力主张万事万物统一于整体的本心或本体，本体只有一个，不是许多个体的集合。万象的统一性体现在本心辟的势用，特殊性体现在翕的势用。
“我们应知，功能所以非一合相者，奇妙就存乎翕。有翕便有分化，才不是一合相。假如没有所谓翕就无从显出对待，无有万殊可言。据此，则翕是分化的，每一个翕，是自成一极小圈子。今试克就辟言，此辟是否真个随翕而分成各个的圈呢？应知，辟的势用虽运于一切翕之中，恒随各个的翕而分成各圈，但辟的本身确实浑一的。可分与不可分，于此都不妨说（辟的势用，既不同实物，不妨说不可分。他是随一切翕，而皆运乎其间的，亦不妨说可分。）”