“扁鹊”本是传说中的黄帝时代的“神医”，但关于此人的资料也仅仅是个传说中的名号而已。我们所说的“神医”扁鹊，乃西汉史学家司马迁在《史记》中为之立传的“神医”秦越人。《史记正义》引《黄帝八十一难序》云：“秦越人与轩辕时扁鹊相类，仍号之为扁鹊。”后世只要提及“扁鹊”，指的就是秦越人，而不是黄帝时代的扁鹊。《史记·扁鹊仓公列传》云：“扁鹊者，勃海郡郑人也，姓秦氏，名越人。”说明扁鹊氏秦，名越人。“扁鹊”之名大概是时人给他起的雅号，以喻其医术之神奇。春秋时人有姓有氏，姓用以别婚姻，氏用以别贵贱。如姜太公姓姜，氏吕。至战国时，姓和氏逐渐合二为一。“秦”乃扁鹊之“氏”，故《史记》说其“姓秦氏”。
一说“越人”乃扁鹊之字，其名叫“少齐”。王叔岷《史记斠证·卷一百五》：“梁玉绳云：‘《周礼·天官》“医疾”释文，引此《传》（即《史记·扁鹊仓公列传》——笔者注）云：“姓秦，名少齐、越人。”则今本脱“少齐”二字，盖有二名。或越人是字。’”东汉高诱注《战国策·秦策二》曰：“扁鹊，卢人也，字越人。”为梁玉绳之说提供了佐证。
但“扁鹊名少齐、字越人”之说，也很可疑。古人取字，是供别人称呼自己的，自己一般不称字，而称名。在《史记》等书中，扁鹊多次自称“越人”，是知“越人”乃扁鹊之名，而非其字。
“扁鹊”这一名号是什么意思呢？日本学者泷川资言《史记会注考证》引《周礼释文》曰：“‘扁’本亦作‘鶣’，蒲典反。”泷川资言认为：“扁鹊系时人所称，以‘扁’为姓，恐谬。下文云‘姓秦氏’，又云‘在赵者名扁鹊’可证也。梁玉绳曰：‘扁鹊’取鹊飞鶣鶣之义。”有人认为“扁”是姓氏，泷川资言并不同意此说，他引《周礼释文》的解释，认为“扁”本是“鶣”字，应读[piān]，并引清代学者梁玉绳的观点：“取鹊飞鶣鶣之义。”“鶣鶣”，现在通常写作“翩翩”。《汉语大词典》“扁”字条下注明又读作[piān]，其第三个解释是：“通‘翩’，参见‘扁扁’。”“扁扁”词条第一个义项为“喜悦貌”。《汉语大词典》“鹊噪”词条引《禽经》：“灵鹊兆喜。”晋代张华注曰：“鹊噪则喜生。”因此鹊又称喜鹊，古人将其视作吉祥喜庆的象征。用喜鹊来比喻神医，说明神医就像翩翩飞来的喜鹊那样，将给病人带来健康吉祥。因此，“扁鹊”，应读作“翩鹊”，意为“翩翩飞来的喜鹊”。