《应用与环境生物学报》投稿指南
1. 稿件初投
在稿件完成拟投本刊前，请作者确保稿件内容不涉及国家机密，无政治错误，符合本刊报道范围（“本刊简介”），取得突破性进展（研究论文）或具有独创性观点（综述），在研究和写作上经过了所有作者的集思广益并认可投稿，无知识产权争议，无作伪、抄袭、“一稿多投”和“香肠论文”（一稿裁多稿）行为，仔细阅读过本刊“投稿指南”和“论文诚信承诺与版权转让协议”，并根据本刊“征稿简则”进行修改和规范后，即可在线投稿。
只接受在线投稿。请自行保存该稿件的电子版以及所有数据资料，以防不时之需，必要时编辑部可能要求作者提供原始数据和文献。（注：稿件初投时，在保证内容质量和遵守国家标准、行业规范的前提下，其格式和规范不一定要完全符合本刊；但经过三审后，若本刊拟录用该稿件，要求作者对稿件除了修改完善内容外，还必须根据本刊“征稿简则”和本刊最新发表论文或“论文模板”格式逐一规范（不分栏），方正式录用。）
在线投稿时，请注意加注星号的必填项和各具体要求，准确给出所有作者的详细联系地址（包括邮编）、E-mail（第一作者和通讯作者的E-mail必填）、电话及个人简介等相关信息，以及其他认为需要特别说明的情况（如稿件的重要性和创新性、是否为本刊约稿、是否有系列论文、是否为知名专家推荐、是否有回避审稿专家等）。若在稿件出版前整个过程中联系方式有变化，请及时更新。
2. 稿件初审
编辑部在系统收到作者投稿后进行初审（编辑/编委专家初审），即通过仔细阅读全文，对稿件的学科专业、学术水平、数据真假、重复情况、语言表达和文体格式等作出初步审查和评价，处理意见主要有2种：
（1）直接退稿：可能理由为稿件内容不符合本刊报道范围、学术水平在本刊近期投稿中相对不高、数据观点或语言表述存在较大缺陷、与已发表文献重复率较高等（由于学位论文已经公开传播，本刊不再接受由学位论文研究结果形成的研究论文）。由于本刊刊稿率（年刊稿数/年收稿数）较低，即退稿率较高，会有较多稿件只经初审而不经同行评审（外审）就被拒绝，请予以理解；这种做法可以提高编辑部后续工作效率，亦可减少稿件在编辑部的无效滞留时间和作者的无效等待时间；编辑部会客观、公平、慎重地对待投稿，有可能会建议该稿件更适合投往哪些或哪种刊物。若有异议，亦可申诉。
（2）受理续审：同意受理该稿件，即通知作者尽快办理“论文诚信承诺与版权转让协议”（最高级基金所属单位盖章）。该稿件即进入同行评审（外审）阶段。
3. 同行评审（外审）
编辑部为每篇稿件选择2-4位外审专家。所选外审专家：与审理稿件所属学科小专业相符合的科研一线人员，高级职称，不含纯粹从事科研管理的人员；能全面、公正地审阅、评价稿件质量；不仅需要指出稿件优缺点，也应提出修改建议，对作者有实质性帮助；能在约定的较短时间内返回评审意见等。
4. 稿件终审
收到稿件所有外审意见后，编委/主编会据此决定该稿件处理结果。本刊根据外审意见并结合本刊具体情况作出选择，有可能是与外审意见相反的选择。审稿顺利的稿件1个月内会告知处理意见，审稿优良且作者按规定时间认真修改返回的稿件2个月以内告知是否录用；少量稿件由于不可预见的因素可能延期，作者经向编辑部申明后可撤稿改投，也可等待本刊的催审或换审意见。处理意见主要有3种：
（1）退稿：一般会告知作者理由，并建议如何改进试验、深入研究或改投他刊等。
（2）录用：通过审稿的稿件，还需要作者根据审稿意见中的合理建议以及编辑部的“征稿简则”和最新发表论文或“论文模板”格式逐一、全面修改全文（不分栏、不加页眉）。修改稿返回同时要附上修改说明，即逐一回答终审意见，哪些方面做了修改，哪些方面予以保留以及保留原因。通讯作者若非执笔作者，必须参与、审定修改稿及修改说明。编辑部收到修改稿后，经核实无误，即正式录用并向作者发出论文录用通知。录用论文经审核梳理后在网上预出版。
（3）退修（退改）：若稿件内容符合本刊，且具有重要的学术意义和创新价值，但由于写作原因导致价值没有体现，或者需要补充一些次要的实验和数据，则退请作者修改后再投。再投稿件需经编辑部及外审专家再次审理后，再决定是否录用。再投稿件也需附充分逐一的修改说明。
一般情况下（如无需补充实验），退改稿件要求在1个月内将修改稿和修改说明返回来。若编辑部拒绝某稿件，也未说明修改后再投，建议作者修改后改投他刊。若作者对审稿意见有异议，可告知理由，编辑部会认真对待、综合审理、妥善处理，并尽快返回最终决定。建议作者在第一次申诉失败后将稿件改投他刊，不要把时间浪费在与编辑部进一步的来回交流上。
5. 网络发表
稿件正式录用后，编辑部根据其收稿日期和修回日期确定正式发表时间。
录用定稿及时网络发表（本刊网站预出版，中国知网首发）。
6. 稿件编排
高创新性稿件、学术价值重大稿件、邀约和专题稿件优先发表。
编辑部对稿件全文进行编辑和排版，修正错误的数据、观点和表述，并予以规范，使文字和图表更具可读性，使版面安排清晰、紧凑，符合本刊的风格。
7. 稿件核对
有所质疑的稿件将返回给作者再作修改。排版稿件由作者和编辑部同步校改，请作者尽量于2日内将校改结果返回编辑部。
校改方法①：直接在排版稿PDF文件中批注修改；方法②：于word中文字或列表叙述哪页、哪栏、哪行的错误，并予以更正；以及其他能清晰显示修改处和修改内容的类似方法。不能采用无痕方式校对。
排版稿及其校对情况必须经通讯作者审定后再返回。
本刊向拟发表论文作者一次性酌收发表费（“费用手续”， 有正式发票），并一次性酌返作者稿费（含版权转让费）。 特别说明：论文如入选封面论文，作者提供最终形成封面主体的照（图）片须作者自有版权或获得授权、此前未授权以及此后不再授权他刊使用，编辑部不另行支付照片稿费；作者提供自有版权的备选或相关照（图）片，本刊可免费非专有使用、进行论文及期刊的传播与宣传。
8. 论文正式出版
当期所有稿件以及期刊封面、封底、目录、补白等，再经编辑部校审和出版社校审后送印刷厂校对、印刷。
同时，当期所有论文电子版全部上网（本刊网站及所有文献数据库），以文摘形式、PDF全文形式提供作者、读者免费阅读和下载。
9. 期刊寄送
本刊免费赠送作者适量当期刊物。