为了提倡数学与其它学科的交叉、渗透和融合，拓展应用数学的研究领域，促进有关交叉学科的发展，本刊物将重点刊登在其它学科（包括物理、化学、生物、信息、材料、能源、环境、经济、金融等方面）中的应用数学概念、理论和方法方面的研究成果或综合介绍，或介绍数学与其它交叉学科的国际前沿动态、现状及发展趋势等。刊物主要对象是大专院校师生，科研部门和生产单位的应用数学工作者及工程技术人员。
《高校应用数学学报》是我国自然科学的核心学术期刊，也是《中国科技论文统计与分析》年度研究报告、中国学术期刊综合评价数据库和中国科学引文数据库的来源期刊。在国外受美国《数学评论》(Mathematical Reviews)、德国《数学文摘》(Zentralblatt für Mathematik/Mathematics Abstracts)、俄罗斯《文摘杂志》（AJ）等文摘刊物及其数据库的收录与评论。1999年被评为全国优秀高校自然科学学报及教育部优秀科技期刊。
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