养殖技术与管理水平是动物疾病风险控制的关键。尽管中国已经实现了大规模集约化养殖，但在养殖技术和管理方面还没有达到应有的水平，导致中国动物疾病频繁发生，养殖环境恶劣，环境污染严重。在这种情况下，动物容易感染疾病或处于亚健康状态。为了维持动物的健康，养殖者必须使用大量抗生素，不断增加养殖成本，畜产品质量反而不断下降，导致经济效益也不断降低，从而发生恶性循环。养殖者可以通过加强学习意识，提高科学养殖的技术水平，动物疾病是可以得到良好的控制与预防。另外，科学的管理方式在动物疾病的预防与控制中也具有重要的价值与意义，养殖户必须提升管理意识水平，从而真正实现科学化管理。进一步完善疾病预防控制制度，真正将动物疾病的预防与控制工作落实到位。
动物疾病新的防治理念应该是以加强动物的免疫体系为主，作为控制传染病的一种手段，免疫在现代动物生产中有着明显的作用，更重要的是，动物免疫后导致细菌抗药性的风险非常低，从而构成了一种真正和广泛适用的抗生素替代品。疫苗由于其迅速的作用，常被用于治疗因感染或病毒引起的疾病，但是也可以提前通过接种免疫，使机体内产生抗体，防止感染得病。规模化、集约化的动物生产系统在发生传染性疾病的时候会影响动物生产力、经济、动物福利和抗生素的广泛使用。免疫是替代抗生素的一种非常有用的方法，可针对不同类型的病原体（细菌、病毒、寄生虫），以防止感染发病，而且细菌的耐药性的问题也随之得到解决。
有学者提出动物疾病控制的可持续发展，就是以畜牧业为基础，通过疾病防控使动物疾病资源成为畜牧业发展的有效保证。建立健全可持续发展的政策保障体系，建立合理开发利用资源的政策体系，将动物疾病的防控延伸到医学、食品工程、生态环境、饲料工业等许多领域。