(一)水技推广、渔政执法、渔船检验、渔港监督四合一机构政事不分。一套人马四个牌子承担了多项职能，即搞水产技术推广又从事行政执法工作，人员须具备有水产专业知识和法律方面知识和渔业船舶方面知识，涉及专业学科多，问题产生的历史原因与其相对的合理性,但从业人员彼于应付，工作压力大。
（二）基层水技推广人员编制少、年龄老化。基层水技推广机构专业人员流失、人员老化、这些因素在一定程度上影响到工作效率，但工作量没有变化，现有的一些体制导致水技术推广人员年龄老化又没到法定退休年龄，本区县级水技站平均年龄达53岁，占用编制，水产技术推广人员年龄结构不合理，出现断层。
（三）渔业科技转化率低。目前，我国农业科技成果转化率和贡献份额均占30％多，远低于发达国家80%以上的水平，主要原因一个是研究成果不是生产当中所需要的，另一个是很多研究课题的确定不是根据生产的发展，生产和科研相脱节的问题比较严重；还有就是渔业科技面临着科技创新能力不足、人才队伍建设相对滞后、投入不足等问题。
（四）基层水技人员专业和知识结构不合理。1、学历高，缺乏实践经验。主要是刚步入水技推广队伍的90后的毕业生，占乡镇水技人员比例35%，虽然具有深厚的理论知识功底，但是实践经验几乎为零；2、学历低，实践经验丰富。主要是40岁以上的年龄段，乡镇这一部分人占的比例在50%；3、既无学历又无实践。这部分人主要是所学专业不对口还有部分转业军人和干部家属。占的比例在15%，不能满足渔民科技养鱼需求。
（五）水产技术推广人员缺少培训机会急需知识更新培训。
水技推广人员只有每年一次的针对所有在职人员的继续再教育培训。渔业推广人员的受教育水平仍然偏低。省级水技骨干人员水技人员培训缺乏规范性系统性和针对性，培训内容与实际相脱离。