1 部分葱农或企业仍不具备较强的品牌意识
虽然目前章丘大葱多通过合作社或小型企业形式进行销售，但是由于销售者往往也是生产者，传统农业生产经营方式的思想依旧根深蒂固，品牌经营主体模糊,品牌意识和市场意识淡薄。甚至有些散户葱农将一般大葱冠当成“章丘大葱”,“绣惠大葱”等知名品牌,以次充好进行外销，这大大损害了章丘大葱的品牌形象，不利于章丘大葱的长远发展。
2 文化发掘不够深刻
目前章丘大葱文化的发掘主要集中在大葱主产地女郎山附近，文化供给创新创意不深，高质量的文化融合农业的产品和服务供给不够充分。部分企业及项目对文化重视不够，缺乏明确的文化定位。文化资源的利用仍以经济目标为主导，缺乏对人文价值的重视。须知，文化一定要与时俱进，切不可固步自封，如果拘泥于目前树立的文化形象，不利于章丘大葱的品牌寿命。
3.高素质创新人才严重不足
虽然章丘大葱品牌已拥有良好的发展基础优势，但是在农产品品牌的建设上，还存在高素质创新人才严重不足的致命问题。从事农产品生产销售的高素质人才数量占比不足农产品从业人员的1%。文化是品牌的旗帜，而人才是品牌旗帜的举旗人，进行充分的文化升华、产品宣传、品种优化都离不开高素质的创新人才。