（一）军地标准不“统”导致难“融”
高校作为我国科技研发力量的重要组成部分，已成为我国自主科技创新重要力量 ，申报和参与国防科研项目是高校参与军民融合式发展的主要途径。行业特色高校的科研工作者经过与民口企业的长期合作，已形成了良好的合作关系和固定的合作模式，对于参与陌生的军用领域有着一定的抵触心理，另外由于部分军用产品和民用商品存在计量标准不统一和指标参数不一致等现象，极大地增加了科研投入和难度，从而降低了科研工作者从民口科研走向国防科研的积极性。此外，由于长期的军民科研分离的情况，从事民口科研和国防科研的科技工作者思维模式有着较大区别，对于科研成果的认定标准也有一定的区别，存在民口高校申请到国防项目后因为工艺路线等原因与指导单位意见无法统一而导致科研项目难以进行的现象。究其原因军地标准不一致是一个重要的影响因素，因此有必要统一相关标准，建立清晰的各级机制，扫除体制和机制的障碍，对于打通军地信息交流，增加军民科研互动有着较为重要的现实意义。
（二）体制机制不“新”导致不“深”
自“十二五”规划以来，各大高校积极响应国家政策，根据自身学校的特点推出了相应的管理办法和激励政策，然而随着军民一体化的不断发展，对于政策落实的深度和广度有了新的要求，现今的体制机制已无法很好的匹配深入发展军民融合的需求，这一现象在行业特色高校较为明显。行业特色高校由于在相关领域具有一定的权威性且具有丰富的科研经验，因此科研活动的产出和投入比较高，获取科研经费也较为容易，相对而言对于进入陌生领域从事国防科研缺乏积极性。另外，由于国防科研具有与民口科研不同的预算体系、管理办法以及细致的审计程序，对于习惯从事民口科研的科研工作者造成了一定的困惑，特别是从事横向科研的研究人员，而这一类人员也恰好是从事军民融合发展的生力军。因此，如果没有相应的机制体制改革军民融合发展将始终流于表面，如何调动研究人员的积极性是一个必须思考的问题。