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《吉林农业大学学报》是吉林农业大学主办的综合性农业科学类学术期刊，国内外公开发行。面向国内外专家、学者组稿。本刊以学术论文、研究简报、综合评述等形式集中报道作物栽培、遗传育种、植物保护、生物工程、生物技术、资源与环境科学、农业化学、农业应用物理、果树、蔬菜、园林、药用植物、中药学、野生植物资源、经济动植物、畜牧兽医、淡水渔业、中兽医、食品科学、农业工程、信息技术等学科及相关领域的基础研究、应用研究和重大开发研究所取得的最新成果。
《吉林农业大学学报》办刊宗旨是反映农业及相关领域最新科研成果，促进国内外学术交流与合作，推进科技进步，促进科技成果的转化，为地方和国家经济发展和建设服务，为我国农业现代化服务。读者对象为农业及相关领域科技工作者、高等院校师生及管理干部。本刊连续多年先后被《中国科技论文统计源》、《中国科学引文数据库》、《中国核心期刊（遴选）数据库》、《中文核心期刊要目总览》《中国科技术期刊文摘（CSTA）数据库》、《中国学术期刊综合评价数据库》、英国《国际农业与生物科学研究中心（CABI）文摘》、美国《农业文献题录》（B of A）、美国《国际药学文摘》（IPA）、英国《动物学记录》（ZR）、俄罗斯《文摘杂志》（AJ）、《中国农业文摘》、《中国生物学文摘》、《中国药学文摘》、《中国林业文摘》、《食品文摘》、《中国期刊网》、《中国学术期刊（光盘版）》、“万方数据库（ChinaInfo）—数字化期刊群”、《中国农业科技文献数据库（CASDD）光盘》等20多种国内外著名检索刊物及文献数据库摘引和全文收录.
1989年以来，学报曾13获次省部级奖励、5次获全国及省级行业学会奖励。其中，1999年获全国优秀高等学校自然科学学报及教育部优秀科技期刊一等奖，1999－2005年连续4次获吉林省自然科学十佳期刊称号，2004年 获北方八省、市、区第一届北方优秀期刊称号，2004年获教育部全国高校优秀科技期刊一等奖，2007年被吉林省人民政府授予吉林省新闻出版奖――期刊精品奖, 2008年获教育部中国高校优秀科技期刊奖,2009年被评为首届吉林名刊, 2009年《吉林农业大学学报》荣获全国高校科技期刊优秀编辑质量奖，2010年获全国高校精品科技期刊奖。