1、浸种
沼液作为浸种剂，不仅能提高作物抗性，杀灭种子表面的病菌，还能促进植物根系发育，提高种子发芽率、成秧率及抗逆性。
（1）沼液浸种营养丰富
沼液浸种能增产增收的主要原因是沼气微生物的代谢物—生物活性物质在起作用。氮、磷、钾等主要营养元素通过浸种能够为种子发芽及幼苗生长提供营养；钙、铁、铜、锌、锰等微量元素在浸种过程中可以渗透到种子细胞内，刺激种子发芽和生长；氨基酸、生长素、赤霉素等生物活性物质可以激活种子内部的酶，刺激胚细胞分裂，促进细胞生长，使种子发芽快、苗齐、苗壮。
（2）沼液浸种杀虫灭菌
沼液是有机物质在沼气池内厌氧发酵的产物，由于在厌氧环境下大量NH4+和HS-的产生，沼液很少带有活性菌和虫卵，施用后能够增强种子的抗病能力。
（3）沼液浸种可以提高作物抗逆性，避免低温影响
种子经浸泡吸水进入萌动状态后，若外界的温度过低，将抑制其正常的生命活动。沼气池出料间内的沼液温度比清水要稍高一些，种子处在适温的环境条件下，新陈代谢活跃，有利于促进种子萌芽，提高种子发芽率。
（4）采用沼液浸种的优点
通过沼液浸种可实现幼苗“胎里壮”。浸泡的种子，芽齐芽壮，成苗率高，根系发达，分蘖多，长势旺，抗旱抗病力强。沼液浸种后的蔬菜有明显的增产效果。实践证明，在
15℃～18℃情况下，瓜类蔬菜种子浸泡2h～4h为宜，茄果类蔬菜种子浸泡4h～6h为宜。
2、用作肥料
（1）用作叶面肥
沼液富含多种作物所需的水溶性营养成分，是一种速效水肥，用于蔬菜叶面施肥，收效快，利用率高，能够及时补给蔬菜生长对养分的需求。通过沼液喷施，茄子植株健壮，叶色浓绿，叶片肥厚，抗病性增强；茄子个大均匀，光泽度高，商品性好。叶面喷施的沼液取自正常产气三个月以上的沼气池中的滤清液，兑水（视浓度而定），搅拌均匀，静置沉淀10小时后，取上清液用喷雾器直接喷洒在叶面上，这能显著提高叶面的叶绿素含量，增加叶片厚度，增强光合作用，提高产量。沼液喷施辣椒，开花授粉正常，坐果率高，辣椒果色泽浓，品质好，辣椒素含量高。苗期嫩叶蔬菜叶面喷施，沼液应稀释10～20倍，中后期叶面喷施应稀释5～10倍。
叶面施用沼液时要注意如下几点：
①必须取自正常产气后3个月的沼气池的沼液；
②沼液必须澄清，以利于喷洒，不堵塞喷头。澄清方法为用纱布或细密的纱窗过滤除去其中固形物；
③喷洒时应在早上8时至10时或下午4时至6时进行，尤其是在夏天中午气温高时不宜喷施，以免灼伤叶片，下雨前不喷洒；
④最好从叶子背面喷洒，因为叶背蜡质少，气孔多，细胞间隙大，容易吸收；
⑤喷洒浓度要适当，沼液和清水比例一般为1:2。
（2）用作根部追肥
沼液作为一种速效液态肥，用作菜田追肥，可在蔬菜生长期开沟或控穴施用。方法如下：在蔬菜根际开沟或开穴，从出料间提取沼液，兑水1～2倍，充分搅匀后施入沟（穴）内，一般用量为每667m2用原液1500kg～2000kg，待沼液完全渗入土壤后即覆土。也可结合灌水，直接将沼液追施到垄面或垄沟内。在瓜类蔬菜花蕾期或果实膨大期追施沼液，能够调节作物生理代谢，补充营养，增强光合作用，防虫抗病，蔬菜和果品成熟一致，商品性好，增产增收效果好。有研究表明，追肥沼液的西瓜，瓜形一致，畸形瓜少，个大均匀，瓤鲜甜度高，口感好。
3、防治病虫害
长期的厌氧环境，使大量的病菌、虫卵、杂草种子窒息而死亡，而且沼液本身含有吲哚乙酸、赤霉素和较高容量的氨和铵盐，可以杀死或抑制种子表面的病菌和虫卵，达到防病灭虫的效果。
（1）防治病虫害原理：研究发现，沼液近30种农作物病害具有防治作用，其中对20多种病害的防治效果达到或超过了现行使用的农药；同时沼液对19种害虫有明显的防治效果；对17种农作物病原菌有不同程度的抑制作用。沼液之所以具有如此优良的抗病虫能力，是因为沼液中含有120多种组成成分，其中有20多种成分使沼液具有抗病防虫的作用，其作用原理表现在3个方面：
①厌氧发酵液中NH4+、乙酸、丁酸、丙酸、赤霉素、吲哚乙酸等具有抑制作用，是抗病防虫的主要因子；
②厌氧发酵液中含有大量的维生素、氨基酸等营养物质，增强了作物的抗病防虫能力；
③施用沼液后在作物周围产生甲烷、乙烯等挥发性气体，形成厌氧微点保护圈，对病菌和害虫进行生理夺氧，从而达到抗病防虫的目的。