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曾用刊名：厦门水产学院学报
《集美大学学报(自然科学版)》（双月刊）创刊于1981年，是集美大学主办主管，国内外发行的综合性自然科学类学术性期刊。本刊坚持正确的办刊方向，以邓小平理论和“三个代表”重要思想为指导，深入贯彻落实科学发展观和构建社会主义和谐社会的重大战略思想，坚持“为人民服务，为社会主义服务”的方向和“百花齐放、百家争鸣”的方针，主要刊登反映自然科学领域的理论研究和应用研究成果的学术论文，发挥本校的学科优势，刊发自然科学领域的理论研究与应用研究成果，促进校内外学术交流，为我校教学科研服务，为我省社会经济发展服务，为科教兴国贡献力量。
《集美大学学报(自然科学版)》主要刊登水产科学、航海轮机、信息科学、机电工程、生物工程、基础学科及相关学科的科研成果。面向高、中等院校水产学科、航海学科、机电学科、信息学科和基础学科的师生，以及各水产、航海、机电、信息、数理化等科研单位、生产企业的科研工作者。获奖情况："华东地区优秀期刊" "中国高校特色科技期刊" "福建省高校优秀学报"。