恩格斯曾说：“历史从哪里开始，思想进程也应当从哪里开始，而思想进程进一步的发展不过是历史过程在抽象的、理论上前后一贯的形式上的反应。”[12]这里说的历史就是指人类的实践活动。如果说理论逻辑是人类历史发展规律的理论呈现，那么实践逻辑是人类历史发展规律的现实展开。把握全面深化改革的实践逻辑，就是要运用辩证思维方法，从历史的纵深处，揭示和把握改革实践进程中的带有规律性的东西。
在改革开放初期，邓小平鼓励人民冲破思想的樊篱，克服“两个凡是”思想束缚，勇于去闯，大胆探索。他指出：“不打破思想僵化，不大大解放干部和群众的思想，四个现代化就没有希望。”[13]由于改革开放是前无古人的事业，没有现成的经验可以借鉴，要发扬“摸着石头过河”精神，要勇于闯荡和敢于人先，在不断探索中闯出一条新路。所以他总强调：“没有一点闯的精神，没有一点‘冒’的精神，没有一股气、劲呀，就走不出一条好路，走不出一条新路，就干不出新的事业”[14]，但邓小平鼓励人们“大胆的闯”和“冒险精神”并不是一味的蛮干，而是注重总结经验教训，认识客观规律。在“试”过程中善于总结，在“闯”的过程中修正失误，他指出：“在改革的过程中会犯错误，会出现问题，关键是要善于总结经验，哪一步走得不妥当，就赶快改。”[15]正是在不断总结和反思的过程中，我们积累的成果经验越来越多，所犯的错误越来越少，从而走上良性改革发展道路。如今我国改革已经进入攻坚期和深水区，在越来越深的水中前行，遇到的阻力必然越来越大，面对的改革道路上的艰难荆棘，现阶段推进改革必须注重整体性和协调性，把握大局，稳重求进，所以习近平强调：“目前的改革不是某一项改革，也不是某一领域改革，而是全面深化各个领域的改革。涉及党和国家工作全局，涉及经济社会发展各领域，涉及许多重大理论问题和实际问题。是一个复杂的系统工程，要解决目前面临的突出矛盾和问题，仅仅依靠单个领域单个层次的改革难以奏效，必须加强顶层设计，整体谋划，增强各项改革的关联性、系统性、协同性。”[16]
党的十八大以来，以习近平为核心的党中央在继承邓小平关于“摸着石头过河”思想，发挥其在改革实践中的指导作用同时，注重改革的顶层设计，实现二者的辩证统一，习近平强调：“加强顶层设计和摸着石头过河是辩证统一的，推进局部的阶段性改革开放要在加强顶层设计的前提下进行，加强顶层设计要在推进局部的阶段性改革开放的基础上来谋划。”[17]人们对“摸着石头过河”思想的理解，不再局限于单一层面，而是拓展到综合领域，进一步丰富和发展了“摸着石头过河”思想。事实上，“顶层设计”和“摸着石头过河”是相互影响、相互支持的关系。没有宏伟的蓝图和合理的规划，即没有科学的“顶层设计”，那么，“石头”摸着再多，也无济于宏伟的蓝图的实现，没有“摸着石头过河”探索精神和实践经验，不善于总结经验和认识规律，也难以制定科学的“顶层设计”，所以，对“顶层设计”和“摸着石头过河”不能输轻属重，而是秉承合理设计、积极探索的原则，协调配合，把“摸着石头过河”和加强顶层设计有机统一起来。