3.1合理利用降水资源、优化灌区水资源分布
降水是一个地区重要的水资源，补给了河流和地下水，降雨量的多少影响着灌区农业用水的多少。一般来说，降雨量多的地区，农业用水量明显减少。我国降水资源的时空分布不均，导致降水资源不能充分利用，在灌区建设和更新改造过程中，将集雨工程与灌溉工程相结合，合理利用降水资源，优化整个灌区水资源量的分配。
3.2制定科学合理的用水计划，优化调度水资源
用水计划是灌区取水配水的依据、是用水管理的中心环节、是发挥灌溉工程效益的重要举措。有计划的蓄水、取水、配水，达到适时适量的灌溉的目的，保证粮食安全、科学利用水资源。在节水技术不断发展完善的同时，发挥水资源的最大生产潜力，优化调度灌区水资源。
3.3提高水资源利用率，优化水资源管理体制
我国是农业大国，农业用水占主导地位，但我国农业水资源利用率相对较低。提高水资源利用率是高效用水的最终目的。在保证各项用水满足需求的前提下，灌区内实现优水优用，积极促进水资源的分类使用，优质水源实现多次利用，提高田间水资源的综合利用率。建立水资源监督管理体系，改善现有水资源管理方式和管理体制。
3.4建立健全水价管理体制机制，优化水资源的法律地位
为适应价值规律和社会经济发展，推进水价体系改革，对不同水资源使用途径和不同水质水资源进行分批次定价，能够有效促进节约用水和水资源的可持续利用，保障我国农田灌溉。同时，确保水资源立法工作，强化水资源使用准则的落实，进一步细化水资源的管理规定和使用范畴，完善水资源的相关法律体系，促进水资源的统一管理，明确水资源的法律地位。
3.5实行最严格水资源管理制度，控制水资源输出途径
最严格水资源管理制度的核心内容是“三条红线”和“四项制度”，灌区内水资源要严格控制其用水许可制度，进一步规范用水管理，严格遵守“三条红线”，落实“四项制度”，为水资源的合理利用提供制度保证。我国是农业大国，也是世界上严重缺水国家之一，灌区农业用水关系着国家的粮食安全问题，因此，要把最严格的水资源管理制度应用到每一个灌区，加大水资源方面的宣传力度和责任考核，减少不必要的水资源输出，确保水资源的科学利用、规范管理覆盖到每个用水单元。
3.6建立水资源信息化平台，构建水资源自动检测系统
进入21世纪，科技飞速发展，以“云计算、物联网、大数据、互联网+”为主的信息技术也被广泛应用。在灌区更新改造过程中，植入信息自动化控制技术，建立水资源信息化平台和自动监测系统，是提高灌区水利工程的安全运行的关键措施，为水资源的科学管理、提高水资源利用率提供了新的途径，促进了灌区现代化管理水平，在灌区水资源优化调度、水资源监测方面具有重要意义。信息技术与水资源管理的有机结合，建立水资源网与信息网的融合，推动数字水利与智慧水利建设，使灌区水资源的优化配置实现数字化和自动化。