1.轻防重养、重治的思想普遍存在 :一是全社会意识还不够。许多人认为动物防疫工作做得好不好与经济社会发展大局关系不大，动物防疫工作可做可不做，甚至有部分群众认为畜禽抗生素增加是因为防疫导致。二是农村畜禽养殖户认识不高。还沿用以前一贯的老方法，土思路，“重养轻防，重治清防”，只顾眼前经济利益，思想意识没有提高。虽然有兽医工作员将重大动物疫苗免费提供给养殖户，但个别养殖户存在着不支持、不理解，拒注的情况。三是防疫人员责任意识不强。一些防疫人员只顾打针，不向养殖户讲解动物防疫的相关知识，导致免疫失败。四是操作规程不到位。导致剂量不足、注射部位不准，使抗体水平达不到标准。五是能够达到一定规模化养殖的农户还不是很多，大多数还是以小规模、散养为主，规模化水平不高，大多数养殖户受传统思想观念的影响较重，防疫可有可无，主动防疫意识淡薄，意识不到动物防疫的重要性和疫病的危害性。总希望有好运气，亦或是靠药物，不舍得在防疫预防上下功夫“预防为主”的方针得不到重视，使得本可以得到控制的疫病出现并逐步蔓延，发病后，由于受利益驱动，个别兽药销售人员，使用大量抗生素给防疫工作诊断带来很大难度。 
2.基层防疫体系不健全，影响疫病防治 :养殖户自身素质普遍较低，主动防疫意识淡薄，购买牲畜家禽时没有严格的检测制度，不能实施新引进的动物隔离观察、消毒处理措施。大部分养殖场和养殖户养殖环境卫生差，消毒措施跟不上，粪污自行处理，随意排放，无法进行消毒净化工作，污染环境也为动物疫病的传播提供了条件，无法切断疫病的传染源和传播途径。
3.基层畜牧兽医站归属不明，体制不顺 : 乡镇畜牧兽医站承担着辖区内的动物防疫、产地检疫、畜禽品种改良、畜牧业技术推广、畜产品质量安全监管以及协助上级畜牧部门开展畜牧兽医执法等项工作。国家每次改革的目的是提高工作效率，加强为民服务为目的，但事与愿违，乡镇畜牧兽医站不是撤销就是合并，成了改革的试验区，牺牲品，编制压缩，人员随意减少，可有可无，这次非瘟疫情防控为我们改革敲响了警钟，基层畜牧兽医站是防控工作的主力军。现如令，基层畜牧兽医站住房破旧，条件简漏，基础设施落后，个人防护措施紧缺。但发生疫情后冲在生产第一线，走村窜户，排查疫情，宣传防控知识，甚至冒着被人畜共患病传染的风险，处理病死畜，采集病料，无害化处理，基层防疫人员默默的丰献，毫无怨言。目前动物疫病复杂多变，防控难度越来越大，面对复杂的动物疫情，应充分考虑乡镇畜牧兽医站存在的必要性，引以此次防控非州猪瘟疫情为诫，科学制定改革方案，合理设置机构，理顺体制，为今后绿色畜牧发展，保障人体健康，食品质量安全着想，加大投入力度，保证人员到位。